אחד מתחומי ההתמחות הבולטים של המכון הוא טיפול בפגיעות ספורט בקרב ילדים ובני נוער. גופו של הספורטאי הצעיר שונה מגוף המבוגר: אזורי הצמיחה בעצמות, הרצועות והגידים עדיין מתפתחים, ולכן הם רגישים לסוגים ייחודיים של פציעות שדורשות גישה טיפולית שונה ומותאמת.

בספורטופדיה מבינים שאבחון מוקדם ומדויק הוא קריטי אצל צעירים: פגיעה שלא מטופלת בזמן עלולה להשפיע לטווח ארוך על התפתחות העצם ועל יכולת התפקוד הגופנית. לכן הצוות מוביל תהליך אבחון ממוקד, ומתאים את פרוטוקול השיקום לשלב ההתפתחות ולרמת הפעילות של כל ילד.